MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 9355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015576	GTG	3	9	2992539	2992547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015576	CGC	2	6	2993304	2993309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_015576	TCG	2	6	2995541	2995546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_015576	GCA	2	6	2995588	2995593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_015576	CCGT	2	8	2995598	2995605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_015576	GAG	2	6	2995633	2995638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015576	CCG	2	6	2995641	2995646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_015576	CCCG	2	8	2996374	2996381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6009	NC_015576	TAA	2	6	2999539	2999544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_015576	GGT	2	6	2999567	2999572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_015576	ACC	2	6	2999972	2999977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_015576	GCC	2	6	3000009	3000014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_015576	CAC	2	6	3000022	3000027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_015576	CA	3	6	3000043	3000048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_015576	C	6	6	3000124	3000129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6016	NC_015576	TGA	2	6	3000142	3000147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015576	GCC	2	6	3000186	3000191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_015576	TACCG	2	10	3000205	3000214	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6019	NC_015576	GGACG	2	10	3000282	3000291	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6020	NC_015576	CAA	2	6	3000299	3000304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_015576	GTG	2	6	3000353	3000358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015576	ACC	2	6	3000408	3000413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_015576	CACC	2	8	3000445	3000452	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6024	NC_015576	CGA	2	6	3000906	3000911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_015576	TAC	2	6	3000941	3000946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_015576	ATG	2	6	3002215	3002220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015576	ACG	3	9	3002259	3002267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_015576	GGGCC	2	10	3005110	3005119	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6029	NC_015576	GCT	2	6	3007703	3007708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_015576	GCCG	2	8	3007726	3007733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_015576	GAGG	2	8	3007963	3007970	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015576	CCG	2	6	3007987	3007992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_015576	GGT	2	6	3008086	3008091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015576	CCTG	2	8	3008094	3008101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_015576	CG	3	6	3008127	3008132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_015576	CGC	2	6	3008221	3008226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_015576	TTC	2	6	3008233	3008238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_015576	CGG	2	6	3008306	3008311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_015576	GCG	2	6	3008327	3008332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_015576	CGG	2	6	3008365	3008370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_015576	GGTG	2	8	3008398	3008405	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015576	CAG	2	6	3008442	3008447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_015576	CTA	2	6	3008588	3008593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_015576	GCG	2	6	3008617	3008622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_015576	CGGA	2	8	3008630	3008637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_015576	GCC	2	6	3008701	3008706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_015576	CGG	2	6	3008769	3008774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_015576	CGC	2	6	3008790	3008795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_015576	CGC	2	6	3008800	3008805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_015576	CCG	2	6	3008835	3008840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_015576	CTG	2	6	3008867	3008872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_015576	GCC	2	6	3008879	3008884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_015576	CGG	2	6	3014132	3014137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_015576	GA	3	6	3014152	3014157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_015576	GCA	3	9	3014163	3014171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_015576	GCC	2	6	3014274	3014279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_015576	CGG	2	6	3014353	3014358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_015576	GCG	2	6	3014424	3014429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_015576	GAA	2	6	3014477	3014482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015576	TGT	2	6	3014558	3014563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_015576	TGT	2	6	3014600	3014605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015576	CGG	2	6	3014612	3014617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_015576	GCG	2	6	3014635	3014640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_015576	AAT	2	6	3014714	3014719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_015576	GCA	2	6	3014787	3014792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_015576	AT	3	6	3014797	3014802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015576	GTC	2	6	3014817	3014822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_015576	CGCCGG	2	12	3014963	3014974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_015576	TAAA	2	8	3014983	3014990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015576	GGC	2	6	3015098	3015103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_015576	GCC	2	6	3015113	3015118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_015576	TCCC	2	8	3015171	3015178	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6073	NC_015576	ACA	2	6	3015222	3015227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_015576	GGC	2	6	3015274	3015279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015576	AGT	2	6	3015280	3015285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015576	GCA	2	6	3015306	3015311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_015576	GCG	3	9	3015341	3015349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_015576	CCAC	2	8	3016843	3016850	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6079	NC_015576	TGG	2	6	3016969	3016974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015576	CCA	2	6	3018579	3018584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_015576	CCAC	2	8	3018803	3018810	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6082	NC_015576	TGG	2	6	3018929	3018934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015576	ACG	2	6	3018967	3018972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_015576	CGAT	2	8	3020009	3020016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_015576	CCG	2	6	3020070	3020075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_015576	AAT	2	6	3020130	3020135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_015576	GCC	2	6	3020290	3020295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_015576	GGA	2	6	3020317	3020322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_015576	CCG	2	6	3020365	3020370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_015576	ATTT	2	8	3020430	3020437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_015576	TCGA	2	8	3020499	3020506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_015576	GCA	2	6	3020518	3020523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_015576	ACG	2	6	3020524	3020529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_015576	A	6	6	3020590	3020595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_015576	TCA	2	6	3020641	3020646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_015576	ATCGTA	2	12	3020742	3020753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6097	NC_015576	CGT	2	6	3020762	3020767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_015576	CTA	2	6	3020818	3020823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_015576	TGC	2	6	3020857	3020862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_015576	ATT	2	6	3020950	3020955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015576	CGA	2	6	3021105	3021110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_015576	GAC	2	6	3021238	3021243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_015576	AT	3	6	3021244	3021249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_015576	CGC	2	6	3021361	3021366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_015576	CGG	2	6	3021368	3021373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_015576	CTT	2	6	3021871	3021876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_015576	CCG	2	6	3021917	3021922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_015576	TTG	2	6	3021926	3021931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_015576	ATG	2	6	3021963	3021968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_015576	CGT	2	6	3021972	3021977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_015576	CG	3	6	3021981	3021986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_015576	CGT	2	6	3022134	3022139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_015576	CAC	2	6	3022177	3022182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_015576	CAC	3	9	3022204	3022212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_015576	GCA	2	6	3022253	3022258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_015576	TCC	2	6	3022304	3022309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_015576	CGCCGG	2	12	3022327	3022338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_015576	CGGGT	2	10	3022348	3022357	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6119	NC_015576	CCA	2	6	3024933	3024938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_015576	C	6	6	3024939	3024944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6121	NC_015576	CGG	2	6	3024950	3024955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_015576	GCG	2	6	3025090	3025095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_015576	CCGC	2	8	3025125	3025132	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6124	NC_015576	TCA	2	6	3025158	3025163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_015576	GGA	2	6	3025209	3025214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_015576	AAT	2	6	3025292	3025297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_015576	CCGCC	2	10	3025351	3025360	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6128	NC_015576	GAG	2	6	3025380	3025385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_015576	TCC	2	6	3025439	3025444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_015576	GCC	2	6	3025475	3025480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_015576	GCC	2	6	3025508	3025513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_015576	GAC	2	6	3025542	3025547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_015576	AG	3	6	3025562	3025567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_015576	CAT	3	9	3025584	3025592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_015576	TGGG	2	8	3025613	3025620	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_015576	TGC	2	6	3026392	3026397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6142	NC_015576	CTC	2	6	3026615	3026620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6143	NC_015576	CAACC	2	10	3026623	3026632	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6144	NC_015576	TCGT	2	8	3026652	3026659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6146	NC_015576	TCC	2	6	3026751	3026756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6153	NC_015576	CGG	2	6	3028788	3028793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6162	NC_015576	GCC	2	6	3036730	3036735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6247	NC_015576	ACGC	2	8	3105030	3105037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6248	NC_015576	AGGC	2	8	3105047	3105054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6249	NC_015576	CGGT	2	8	3109179	3109186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6250	NC_015576	GAC	2	6	3109232	3109237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_015576	CGAA	2	8	3111426	3111433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6252	NC_015576	CGA	2	6	3111554	3111559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_015576	GC	3	6	3111579	3111584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_015576	GCT	2	6	3111594	3111599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_015576	CTA	2	6	3111604	3111609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6256	NC_015576	CACG	2	8	3111634	3111641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6257	NC_015576	CCG	2	6	3111653	3111658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6258	NC_015576	CGC	2	6	3111682	3111687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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